הכשרות המרכז להתמקצעות ארגונים משלבות בין מיומנויות ניהול ובין מימדי הפעולה הייחודיים לארגוני החברה האזרחית.
פיתוח ההכשרות נעשה דרך למידה משותפת של צוות שיתופים עם הארגונים הנכנסים לתהליך ההכשרה. שיטת OJT שבה ההכשרות מתבצעות בשדה העבודה של הארגון (ולא בכיתות). אנו בשלבים שונים של תהליכי הכשרה עם מנהלי מרכזי הצעירים של הג'וינט, ארגון "לתת" על שלוחותיו הרבות ומנהלי קהילות של מרכז קהילות שחף.

מרכז "מנטורינג" מפגיש ומפעיל צמדי מנטורים מתנדבים מעולם העסקים ומנהלי ארגונים חברתיים, כדי לסייע לארגונים חברתיים להתמקצע ולהתייעל. זאת, מתוך ראיית שיתוף הפעולה בין המגזרים כמנוף צמיחה ומחולל שינוי.

תכנית "אבני דרך" לחיזוק  ארגוני חברה אזרחית באזורי עימות בתמיכת קמפיין החירום של ארגון קהילות צפון אמריקה (UJC). ובשיתוף קרן שמש ושתי"ל.  מטרת התוכנית: חיזוק תשתיות ארגוניות, אנושיות ושיפור סביבת עבודה של ארגוני חברה אזרחית, כנותני שירותים ומעסיקים, באזורי עימות (אזור הצפון ואזור עוטף עזה)